根據(jù)中央建設(shè)創(chuàng)新型國家的總體戰(zhàn)略目標和國家中長期科技發(fā)展規(guī)劃綱要，結(jié)合中國科學(xué)院科技布局調(diào)整的要求，圍繞深圳市實施創(chuàng)新型城市戰(zhàn)略，2006年2月，中國科學(xué)院、深圳市人民政府及香港中文大學(xué)友好協(xié)商，在深圳市共同建立中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院（以下簡稱“深圳先進院”），實行理事會管理，探索體制機制創(chuàng)新。

經(jīng)過十三年發(fā)展，深圳先進院目前已初步構(gòu)建了以科研為主的集科研、教育、產(chǎn)業(yè)、資本為一體的微型協(xié)同創(chuàng)新生態(tài)系統(tǒng)，由九個研究平臺（中國科學(xué)院香港中文大學(xué)深圳先進集成技術(shù)研究所、生物醫(yī)學(xué)與健康工程研究所、先進計算與數(shù)字工程研究所、生物醫(yī)藥與技術(shù)研究所、廣州中國科學(xué)院先進技術(shù)研究所、腦認知與腦疾病研究所、合成生物學(xué)研究所（籌）、先進材料科學(xué)與工程研究所（籌）、前瞻性科學(xué)與技術(shù)中心），國科大深圳先進技術(shù)學(xué)院，多個特色產(chǎn)業(yè)育成基地（深圳龍華、平湖及上海嘉定）、多支產(chǎn)業(yè)發(fā)展基金、多個具有獨立法人資質(zhì)的新型專業(yè)科研機構(gòu)（深圳創(chuàng)新設(shè)計研究院、深圳北斗應(yīng)用技術(shù)研究院、中科創(chuàng)客學(xué)院、濟寧中科先進技術(shù)研究院、天津中科先進技術(shù)研究院、珠海中科先進技術(shù)研究院、蘇州先進技術(shù)研究院、杭州先進技術(shù)研究院、武漢中科先進技術(shù)研究院、山東中科先進技術(shù)研究院）等組成。 

2018年，深圳先進院獲批牽頭建設(shè)深圳市兩大重大科技基礎(chǔ)設(shè)施：腦解析與腦模擬，合成生物研究；并正在全力籌建深港腦科學(xué)中心，合成生物學(xué)、先進電子材料等國際創(chuàng)新研究院；未來將在河套深港科技創(chuàng)新合作區(qū)布局建設(shè)“深港生物醫(yī)藥創(chuàng)新研究院”、“深港優(yōu)異醫(yī)療設(shè)備創(chuàng)新中心”及“前瞻性國際化綜合性研發(fā)平臺”等創(chuàng)新平臺。2018年11月16日，深圳市人民政府與中國科學(xué)院在深簽署《合作共建中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)協(xié)議書》，依托深圳先進院及中科院在粵科研力量建設(shè)中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)（暫定名）。

使命和愿景 Mission and Vision  

建設(shè)上等的工業(yè)研究院  

提升粵港地區(qū)及我國先進制造業(yè)和現(xiàn)代服務(wù)業(yè)的自主創(chuàng)新能力，推動我國自主知識產(chǎn)權(quán)新工業(yè)的建立，成為國際上等的工業(yè)研究院。 

目標 Goals  

“一個引領(lǐng)、兩個接軌、三個上等、四個能力”  

一個引領(lǐng)—在國家創(chuàng)新體系和區(qū)域源頭創(chuàng)新活動中起骨干和引領(lǐng)作用，包括核心技術(shù)、產(chǎn)業(yè)共性技術(shù)、人才教育、企業(yè)孵化等多方面的示范作用，成為新型國家研究機構(gòu)的典范。 

兩個接軌—“與國際學(xué)術(shù)水平接軌、與珠三角的產(chǎn)業(yè)接軌，是實現(xiàn)“一個引領(lǐng)”的前提條件，頂天才能立地。  

三個上等—“人才上等、科研上等、管理上等”，是實現(xiàn)“兩個接軌”的基礎(chǔ)。  

四個能力—“發(fā)揮學(xué)科交叉特色，形成集成創(chuàng)新新優(yōu)勢，建立經(jīng)濟預(yù)測機制，培養(yǎng)市場拓展能力。  

深圳先進院積極貫徹中國科學(xué)院“三個面向”“四個率先”的新時期辦院方針，即“面向世界科技前沿、面向國家重大需求、面向國民經(jīng)濟主戰(zhàn)場，率先實現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展、率先建成國家創(chuàng)新人才高地、率先建成國家高水平科技智庫、率先建設(shè)國際上等科研機構(gòu)”，發(fā)揮中科院、深圳市、港中大三方共建優(yōu)勢，力爭打造人才上等、科研上等、管理上等的新型研究機構(gòu)。 

深圳先進院的“一+三+N”  

一個定位： 

發(fā)揮在建設(shè)創(chuàng)新性國家過程中的“火車頭”作用，成為國家和人民可信賴、可依靠的戰(zhàn)略科技力量，引領(lǐng)和支持我國可持續(xù)發(fā)展。提升粵港地區(qū)及我國制造業(yè)、現(xiàn)代服務(wù)業(yè)和醫(yī)療醫(yī)藥等領(lǐng)域的自主創(chuàng)新能力，成為新型國際上等的工業(yè)研究院。 

三大突破： 

突破一：優(yōu)異醫(yī)療影像  

突破二：低成本健康  

突破三：醫(yī)用機器人與功能康復(fù)技術(shù)  

N個重點培育： 

城市大數(shù)據(jù)計算  

非人靈長類腦疾病動物模型  

先進電子封裝材料 

腫瘤精準治療技術(shù) 

合成生物器件關(guān)鍵技術(shù)……